ibeerebg

Phosphorylation n mu oluṣakoso idagbasoke titun ṣiṣẹ DELLA ni Arabidopsis nipa igbega si ajọṣepọ ti histone H2A pẹlu chromatin.

Awọn ọlọjẹ DELLA jẹ oluwa ti a fipamọawọn olutọsọna idagbasoketi o ṣe ipa aringbungbun ni ṣiṣakoso idagbasoke ọgbin ni idahun si awọn ifẹnule inu ati ayika. DELLA n ṣiṣẹ bi olutọsọna transcriptional ati pe o gba iṣẹ lati fojusi awọn olupolowo nipa dipọ si awọn ifosiwewe transcription (TFs) ati histone H2A nipasẹ agbegbe GRAS rẹ. Awọn ijinlẹ aipẹ ti fihan pe iduroṣinṣin DELLA ti wa ni ilana lẹhin-itumọ nipasẹ awọn ọna ṣiṣe meji: polyubiquitination ti a fa nipasẹ phytohormone gibberellin, eyiti o yori si ibajẹ iyara rẹ, ati isọdọkan ti awọn oluyipada ubiquitin-bi kekere (SUMO) lati mu ikojọpọ rẹ pọ si. Ni afikun, iṣẹ-ṣiṣe DELLA jẹ ilana ni agbara nipasẹ awọn glycosylations oriṣiriṣi meji: ibaraenisepo DELLA-TF jẹ imudara nipasẹ O-fucosylation ṣugbọn idinamọ nipasẹ O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) iyipada. Sibẹsibẹ, ipa ti DELLA phosphorylation ko ṣiyemeji, gẹgẹbi awọn iwadi iṣaaju ti ṣe afihan awọn esi ti o fi ori gbarawọn, ti o wa lati awọn ti o fihan pe phosphorylation ṣe igbega tabi dinku ibajẹ DELLA si awọn miiran ti o fihan pe phosphorylation ko ni ipa lori iduroṣinṣin rẹ. Nibi, a ṣe idanimọ awọn aaye phosphorylation ni REPRESSORga1-3(RGA, AtDELLA) sọ di mimọ lati Arabidopsis thaliana nipasẹ itupalẹ spectrometry pupọ ati fihan pe phosphorylation ti awọn peptides RGA meji ni awọn agbegbe PolyS ati PolyS/T ṣe igbega isọpọ H2A ati imudara iṣẹ ṣiṣe RGA. Ẹgbẹ ti RGA pẹlu awọn olupolowo ibi-afẹde. Ni pataki, phosphorylation ko ni ipa awọn ibaraẹnisọrọ RGA-TF tabi iduroṣinṣin RGA. Iwadii wa ṣe afihan ẹrọ molikula nipasẹ eyiti phosphorylation nfa iṣẹ ṣiṣe DELLA.
Lati ṣe alaye ipa ti phosphorylation ni ṣiṣakoso iṣẹ DELLA, o ṣe pataki lati ṣe idanimọ awọn aaye phosphorylation DELLA ni vivo ati ṣe awọn itupalẹ iṣẹ ni awọn ohun ọgbin. Nipa isọdi mimọ ti awọn ayokuro ọgbin ti o tẹle nipasẹ itupalẹ MS/MS, a ṣe idanimọ ọpọlọpọ awọn phosphosites ni RGA. Labẹ awọn ipo ti aipe GA, RHA phosphorylation pọ si, ṣugbọn phosphorylation ko ni ipa lori iduroṣinṣin rẹ. Ni pataki, awọn igbelewọn àjọ-IP ati ChIP-qPCR fi han pe phosphorylation ni agbegbe PolyS / T ti RGA n ṣe agbega ibaraenisepo rẹ pẹlu H2A ati ajọṣepọ rẹ pẹlu awọn olupolowo ibi-afẹde, ti n ṣafihan ilana nipasẹ eyiti phosphorylation nfa iṣẹ RGA ṣiṣẹ.
RGA ti wa ni igbasilẹ lati fojusi chromatin nipasẹ ibaraenisepo ti subdomain LHR1 pẹlu TF ati lẹhinna sopọ mọ H2A nipasẹ agbegbe PolyS/T ati subdomain PFYRE, ti o n ṣe eka H2A-RGA-TF lati ṣe iduroṣinṣin RGA. Phosphorylation ti Pep 2 ni agbegbe PolyS/T laarin agbegbe DELLA ati agbegbe GRAS nipasẹ kinase ti a ko ṣe idanimọ ṣe imudara asopọ RGA-H2A. Awọn amuaradagba mutant rgam2A pa RGA phosphorylation kuro ati gba ibaramu amuaradagba ti o yatọ lati dabaru pẹlu isopọmọ H2A. Eyi ni abajade aifọkanbalẹ ti awọn ibaraenisepo TF-rgam2A igba diẹ ati iyapa rgam2A lati chromatin ibi-afẹde. Nọmba yii ṣe afihan ifasilẹ transcriptional ti RGA nikan. Apẹrẹ ti o jọra ni a le ṣapejuwe fun imuṣiṣẹ transcriptional mediated RGA, ayafi ti eka H2A-RGA-TF yoo ṣe agbega transcription jiini ibi-afẹde ati dephosphorylation ti rgam2A yoo dinku transcription. Olusin títúnṣe lati Huang et al.21.
Gbogbo data pipo ni a ṣe atupale ni iṣiro nipa lilo Excel, ati pe awọn iyatọ pataki ni a pinnu nipa lilo idanwo Student's t. Ko si awọn ọna iṣiro ti a lo lati pinnu ni iṣaaju iwọn iwọn ayẹwo. Ko si data ti a yọkuro lati inu itupalẹ; ṣàdánwò ti a ko ti aileto; awọn oniwadi ko ni afọju si pinpin data lakoko idanwo ati igbelewọn awọn abajade. Iwọn ayẹwo jẹ itọkasi ni arosọ eeya ati faili data orisun.
Fun alaye diẹ sii nipa apẹrẹ ikẹkọ, wo Abstract Portfolio Adayeba ti o ni nkan ṣe pẹlu nkan yii.
Awọn data proteomics spectrometry Mass ti ni idasi si ProteomeXchange consortium nipasẹ ibi ipamọ alabaṣepọ PRIDE66 pẹlu idamọ dataset PXD046004. Gbogbo awọn data miiran ti o gba lakoko iwadii yii ni a gbekalẹ ni Alaye Ipilẹṣẹ, Awọn faili Data Afikun, ati Awọn faili Data Raw. A pese data orisun fun nkan yii.

 

Akoko ifiweranṣẹ: Oṣu kọkanla-08-2024